Tous comme le premier, Mega Man 2 a été porté sur PC Engine par un développeur d'homebrews: BonkNuts. Le Dr Wily et sa clique de robots maléfiques sont de retour. Cette suite conserve le gameplay du jeu d'origine et voit le petit Mega Man parcourir huit niveaux pour affronter ses huit nouveaux adversaires. Comme dans le premier jeu, le héros récupère les pouvoirs de ses ennemis lorsqu'il arrive à les battre.