Dans cette suite, vous avez de nouveau affaire avec le scientifique diabolique Edgar Ektor. Lui et ses sombres projets sont de retour, et c'est en tant qu'Aero la chauve souris que vous devrez naturellement le vaincre une nouvelle fois avant qu'il n'accomplisse son diabolique "Plan B".
Le jeu ne change pas, ou très peu, et vous devrez encore sauter aux bons endroits, éviter les pièges mortels et progresser dans le temps imparti. Aero possède toutefois quelques nouveaux mouvements et dispose de plus de mécanismes à utiliser et de plus d'objets à collecter.